146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2511 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 490 aa  981    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  44.76 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  37.26 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  36.23 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  38.89 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  33.72 
 
 		 433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  37.61 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  47.06 
 
 		 472 aa  181  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  28.4 
 
 		 439 aa  180  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  47.06 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  47.06 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  38.27 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  37.91 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  43.32 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  36.74 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  38.64 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  39.29 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  39.63 
 
 		 410 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  40.54 
 
 		 402 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  34.47 
 
 		 400 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  35.14 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  38.97 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  42.7 
 
 		 190 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  37.34 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  36.24 
 
 		 399 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  34.66 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  34.35 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  34.12 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  35.15 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  37.2 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  35.06 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  37.84 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  35.74 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  35.12 
 
 		 411 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  34.47 
 
 		 423 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  37.1 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  34.89 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  33.73 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  35.96 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  35.96 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  34.98 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  34.84 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  34.73 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  38.81 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  32.97 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  34.89 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  37.83 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  34.47 
 
 		 423 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  34.04 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  41.62 
 
 		 428 aa  146  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  35.02 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  37.23 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  38.21 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  35.78 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  30.43 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  35.21 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  34.07 
 
 		 405 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  34.72 
 
 		 401 aa  144  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  34.21 
 
 		 401 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  34.38 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  36.68 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  36.79 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  37.81 
 
 		 408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  33.19 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  35.78 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  35.05 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  40.33 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  36.6 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  33.79 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  36.92 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  35.5 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  32.18 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  35.45 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  34.38 
 
 		 422 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  39.01 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  36.36 
 
 		 384 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  35.91 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  39.89 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  36 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  33.64 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5547  conjugation TrbI family protein  36.61 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167146 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  29.68 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  31.39 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  31.39 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  33.51 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  29.41 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  32.11 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  32.64 
 
 		 469 aa  103  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  32.26 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  32.45 
 
 		 419 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  30.53 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  29.08 
 
 		 450 aa  98.2  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.44 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  33.15 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  30.6 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>