141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5547 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5547  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 424 aa  865    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167146 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  68.01 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  39.91 
 
 		 414 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  34.82 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  34.82 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  40.62 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  39.89 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  33.2 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  39.89 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  37.95 
 
 		 444 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  26.93 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  32.92 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  34.95 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  32.35 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  32.35 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  32.35 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  29.63 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  30.27 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  28.57 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  30.73 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  32.4 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  30 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  33.7 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  31.64 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  34.04 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  32.58 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  26.23 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  27.52 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  24.33 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  32.09 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  31.5 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  30.65 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  29.44 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  32.76 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  31.15 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  32.24 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  30.6 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  29.89 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  32.79 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  31.28 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  30.3 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  30.56 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  31.22 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  31.22 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  30.81 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  26.64 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  31.46 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  30.69 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  30.73 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  29.63 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  31.12 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  32.6 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  31 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  29.67 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  27.18 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  31.87 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  30.73 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  29.67 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  29.94 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  32.37 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  31.21 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  32.37 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  27.75 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  31.79 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  29 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  29.19 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  27.23 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  31.79 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  30.98 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  31.16 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  29.03 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  31.67 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  27.27 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  31.21 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  31.21 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  23.08 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  30.21 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  31.21 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  28.49 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  32.37 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  26.83 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  28.64 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  30.64 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  31.03 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  30.64 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  30.64 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  30.64 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  30.06 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  29.53 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  27.71 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  28.65 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  30.64 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  23.41 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  25 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  28.5 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  25.85 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  26.85 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  28.32 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  29.05 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>