146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pVir0003 on replicon NC_008770
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  100 
 
 
378 aa  765    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  30.37 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  30.37 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  30.37 
 
 
472 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  32.47 
 
 
406 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  35.29 
 
 
400 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  33.87 
 
 
403 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  32.99 
 
 
402 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  38.4 
 
 
486 aa  100  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  31.09 
 
 
410 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  31.46 
 
 
437 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  29.84 
 
 
437 aa  96.3  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  32.31 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  34.59 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  30.77 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  31.11 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  32.24 
 
 
335 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  30.06 
 
 
431 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  31.82 
 
 
402 aa  92.8  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  30.54 
 
 
395 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  27.19 
 
 
466 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  28.35 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  29.89 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  26.29 
 
 
459 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.82 
 
 
444 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  28.96 
 
 
447 aa  89.4  9e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  28.02 
 
 
445 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  30.29 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 
459 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  28.65 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  31.96 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  32.24 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  30.61 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  29.12 
 
 
393 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  31.63 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  26.92 
 
 
457 aa  87  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  31.79 
 
 
405 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  29.1 
 
 
392 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  30.11 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  26.2 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  32.6 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  31.69 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  32.42 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  29.51 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  31.15 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  30.06 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  28.89 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  38.74 
 
 
445 aa  84  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  30.11 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  27.89 
 
 
465 aa  84  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  30.11 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  28.18 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  28.41 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  29.89 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  32.37 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  28.35 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  29.12 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  29.83 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  32.14 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  32.26 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  27.37 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  27.47 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  32.4 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  29.15 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  29.67 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  30.18 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  29.41 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  30.21 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  28.4 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  31.15 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  31.15 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  28.02 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  29.67 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  28.42 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  29.67 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  27.08 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  27.94 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  33.86 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  31.84 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  28.47 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  25.54 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  29.67 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  30.22 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  30.22 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  26.11 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  26.11 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  27.42 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  30.51 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  26.74 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  26.67 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  26.19 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  27.62 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  27.53 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  25.57 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  29.2 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  26.86 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6569  conjugation TrbI family protein  26.55 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  26.63 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  33.97 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>