More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4147 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2428  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.92 
 
 		 685 aa  783    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4147  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 694 aa  1424    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0512  ABC transporter-related protein  66.86 
 
 		 699 aa  934    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  29.7 
 
 		 713 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  27.86 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  27.9 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  27.85 
 
 		 725 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2136  type I protein secretion ATP-binding protein  26.13 
 
 		 704 aa  187  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  27.89 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  28.62 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  28.83 
 
 		 726 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.18 
 
 		 731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  27.89 
 
 		 725 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  26.95 
 
 		 737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  27.89 
 
 		 725 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  27.89 
 
 		 725 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  27.13 
 
 		 740 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  27.21 
 
 		 734 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  27.37 
 
 		 725 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  27.29 
 
 		 704 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  30.77 
 
 		 722 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  27.19 
 
 		 725 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  27.08 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  28.47 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  27.11 
 
 		 725 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  28.67 
 
 		 718 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  26.21 
 
 		 704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  28.01 
 
 		 731 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 		 727 aa  173  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  27.05 
 
 		 723 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  27.84 
 
 		 733 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  26.97 
 
 		 718 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  26.94 
 
 		 725 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  27.76 
 
 		 721 aa  171  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  26.5 
 
 		 718 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  25.64 
 
 		 762 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  28.6 
 
 		 716 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  27.03 
 
 		 718 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  27.14 
 
 		 725 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 		 707 aa  168  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  26.76 
 
 		 573 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  27.64 
 
 		 733 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.84 
 
 		 865 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  25.76 
 
 		 712 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.09 
 
 		 694 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  27.59 
 
 		 727 aa  167  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  28 
 
 		 779 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  26.69 
 
 		 718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  26.76 
 
 		 719 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.97 
 
 		 725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  26.5 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  26.33 
 
 		 721 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  28.15 
 
 		 719 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  25.32 
 
 		 720 aa  164  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.96 
 
 		 1000 aa  163  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  24.24 
 
 		 712 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  27.77 
 
 		 721 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  23.99 
 
 		 701 aa  161  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4512  ABC transporter related  28.07 
 
 		 745 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  27.46 
 
 		 718 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 		 720 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  26.57 
 
 		 711 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  28.24 
 
 		 718 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  28.24 
 
 		 718 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.81 
 
 		 570 aa  160  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 892 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  26.25 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  24.6 
 
 		 718 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  26.17 
 
 		 776 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  27.02 
 
 		 711 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  28.16 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  26.39 
 
 		 706 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  27.84 
 
 		 712 aa  160  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  25.96 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  26.38 
 
 		 718 aa  159  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  26.96 
 
 		 734 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  27.54 
 
 		 739 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 724 aa  158  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 724 aa  158  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.86 
 
 		 713 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  25 
 
 		 712 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  25.22 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  25.27 
 
 		 725 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  27.81 
 
 		 719 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  24.81 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  27.03 
 
 		 920 aa  156  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  28.44 
 
 		 569 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  23.55 
 
 		 982 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  27.26 
 
 		 574 aa  153  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  26.31 
 
 		 722 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  26.31 
 
 		 722 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  24.35 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.08 
 
 		 1019 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  26.49 
 
 		 722 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  26.22 
 
 		 738 aa  152  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  25.87 
 
 		 767 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.7 
 
 		 723 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  26.94 
 
 		 722 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  26.12 
 
 		 756 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  24.22 
 
 		 714 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>