More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0512 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2428  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.89 
 
 		 685 aa  798    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4147  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  66.86 
 
 		 694 aa  943    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0512  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 699 aa  1415    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  29.27 
 
 		 713 aa  281  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  27.94 
 
 		 737 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2136  type I protein secretion ATP-binding protein  27.15 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.87 
 
 		 731 aa  198  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  29.27 
 
 		 740 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  29.47 
 
 		 727 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  28.39 
 
 		 725 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  27.74 
 
 		 723 aa  193  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  28.34 
 
 		 725 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  28.15 
 
 		 725 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.04 
 
 		 725 aa  190  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  28.15 
 
 		 725 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  27.66 
 
 		 725 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  28.15 
 
 		 725 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  28.15 
 
 		 725 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  28.39 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  26.12 
 
 		 712 aa  188  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  27.73 
 
 		 726 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  25.56 
 
 		 712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  27.12 
 
 		 730 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  27.95 
 
 		 726 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  27.44 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  27.24 
 
 		 726 aa  184  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  28.19 
 
 		 721 aa  183  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  28.6 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  26.85 
 
 		 718 aa  182  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  26.01 
 
 		 734 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 		 733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  28.2 
 
 		 721 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  25.56 
 
 		 725 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  26.16 
 
 		 727 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  26.25 
 
 		 718 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  26.71 
 
 		 731 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  26.07 
 
 		 718 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  26.52 
 
 		 704 aa  178  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 		 779 aa  178  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.81 
 
 		 694 aa  177  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  28.6 
 
 		 733 aa  177  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  27.97 
 
 		 725 aa  177  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  26.31 
 
 		 720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 		 573 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  27.09 
 
 		 776 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  29.93 
 
 		 722 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  25.95 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  27.9 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  27.62 
 
 		 721 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  24.92 
 
 		 724 aa  171  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  24.92 
 
 		 724 aa  171  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.39 
 
 		 711 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  27.75 
 
 		 716 aa  170  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  27.39 
 
 		 704 aa  170  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  28.08 
 
 		 718 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  26.47 
 
 		 718 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  27.59 
 
 		 739 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.95 
 
 		 865 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  26.4 
 
 		 718 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  27.19 
 
 		 726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  26.99 
 
 		 734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  24.44 
 
 		 982 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  28.37 
 
 		 719 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  28.14 
 
 		 718 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  28.14 
 
 		 718 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  25.63 
 
 		 719 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  28.14 
 
 		 718 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  27.26 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  26.73 
 
 		 867 aa  162  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  26.45 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  26.81 
 
 		 738 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  27.99 
 
 		 569 aa  162  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  27.7 
 
 		 719 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.81 
 
 		 739 aa  161  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.44 
 
 		 570 aa  160  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  25.3 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  24.07 
 
 		 762 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  26.04 
 
 		 712 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  27.75 
 
 		 718 aa  158  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4512  ABC transporter related  27.75 
 
 		 745 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.59 
 
 		 713 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  25.86 
 
 		 767 aa  158  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  26.53 
 
 		 712 aa  158  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2135  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  24.87 
 
 		 581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  26.53 
 
 		 712 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  25.13 
 
 		 707 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  28.44 
 
 		 722 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 1000 aa  157  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  28.44 
 
 		 722 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  27.34 
 
 		 886 aa  157  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  23.59 
 
 		 725 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  25.69 
 
 		 738 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  24.08 
 
 		 743 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  22.68 
 
 		 731 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  24.3 
 
 		 892 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  26.5 
 
 		 719 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  24.95 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  26.46 
 
 		 712 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  26.11 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  27.11 
 
 		 776 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>