More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5958 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 569 aa  1119    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  61.47 
 
 		 573 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  41.37 
 
 		 580 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.55 
 
 		 591 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  43.67 
 
 		 598 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  44.51 
 
 		 603 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.01 
 
 		 584 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  42.6 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.34 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  42.91 
 
 		 578 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  42.54 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  41.31 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.4 
 
 		 596 aa  403  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.93 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  38.25 
 
 		 583 aa  402  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.32 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  42.62 
 
 		 572 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.3 
 
 		 595 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  41.36 
 
 		 575 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.81 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  41.56 
 
 		 593 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  41.45 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.34 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  37.68 
 
 		 590 aa  386  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  41.5 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  40.82 
 
 		 602 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.16 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  41.39 
 
 		 602 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  41.2 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  42.17 
 
 		 593 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  41.95 
 
 		 579 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  39.81 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  38.75 
 
 		 576 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  42.33 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  40.19 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  41.94 
 
 		 587 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  36.92 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  38.4 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  39.47 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  38.33 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.7 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  34.24 
 
 		 581 aa  369  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  37.29 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  41.79 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  39.89 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  40.62 
 
 		 588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  41.23 
 
 		 573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  39.75 
 
 		 598 aa  361  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 		 571 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  39.81 
 
 		 573 aa  360  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  41.4 
 
 		 587 aa  359  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  38.63 
 
 		 591 aa  359  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  40.97 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  40.26 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  37.73 
 
 		 582 aa  356  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  40.54 
 
 		 575 aa  357  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  38.13 
 
 		 581 aa  356  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  40.45 
 
 		 578 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  38.62 
 
 		 579 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  38.73 
 
 		 663 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  40.84 
 
 		 580 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  39.33 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  37.5 
 
 		 591 aa  350  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  41.22 
 
 		 614 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  38.15 
 
 		 764 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.43 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 		 589 aa  347  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  36.91 
 
 		 782 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.6 
 
 		 587 aa  346  8e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.52 
 
 		 574 aa  345  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  37.9 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  44.16 
 
 		 595 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  37.79 
 
 		 742 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.31 
 
 		 563 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  38.1 
 
 		 576 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.64 
 
 		 583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  43.78 
 
 		 596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.7 
 
 		 582 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  39.03 
 
 		 582 aa  337  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  38.52 
 
 		 582 aa  336  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.92 
 
 		 671 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  38.25 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3974  type I secretion system ATPase  36.1 
 
 		 572 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  38.06 
 
 		 668 aa  334  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  38.28 
 
 		 577 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.36 
 
 		 587 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  39.47 
 
 		 581 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  39.96 
 
 		 600 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  36.02 
 
 		 583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  38.09 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  38.49 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.82 
 
 		 667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  36.98 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  38.8 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  38.8 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  38.13 
 
 		 588 aa  326  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  37.82 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  38.98 
 
 		 574 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  39.15 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>