More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0679 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  100 
 
 
572 aa  1137    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  58.46 
 
 
582 aa  631  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  53.49 
 
 
573 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  51.03 
 
 
561 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  52.21 
 
 
587 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  49.08 
 
 
581 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  43.36 
 
 
582 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  41.93 
 
 
578 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  41.93 
 
 
578 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.41 
 
 
591 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  41.45 
 
 
580 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  41.74 
 
 
578 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.77 
 
 
596 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.58 
 
 
585 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.29 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.17 
 
 
585 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  42.08 
 
 
588 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.55 
 
 
598 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  40.4 
 
 
575 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.53 
 
 
556 aa  389  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  38.64 
 
 
603 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  39.93 
 
 
593 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  39.92 
 
 
602 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.33 
 
 
595 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  39.73 
 
 
602 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  39.92 
 
 
602 aa  382  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  39.56 
 
 
593 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  40.8 
 
 
575 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  37.45 
 
 
643 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  38.31 
 
 
574 aa  375  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  40.27 
 
 
619 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.83 
 
 
573 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  34.01 
 
 
570 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  36.84 
 
 
588 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
599 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  39.58 
 
 
581 aa  360  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  35.25 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  39.96 
 
 
579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  38.36 
 
 
572 aa  349  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  37.06 
 
 
587 aa  347  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.24 
 
 
570 aa  347  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  42.26 
 
 
595 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  42.64 
 
 
596 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  37.38 
 
 
587 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  38.1 
 
 
588 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  37.61 
 
 
587 aa  340  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  36.31 
 
 
569 aa  339  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  35.34 
 
 
591 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  35.54 
 
 
589 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  35.27 
 
 
573 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  40.15 
 
 
575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  37.38 
 
 
587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  35.17 
 
 
590 aa  329  8e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  36.28 
 
 
578 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  35.04 
 
 
742 aa  326  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  34.5 
 
 
579 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.51 
 
 
592 aa  325  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  36.47 
 
 
578 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  36.11 
 
 
580 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  33.4 
 
 
571 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.99 
 
 
574 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  36.96 
 
 
577 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  35.23 
 
 
663 aa  323  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  35.28 
 
 
573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  34.38 
 
 
576 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  35.23 
 
 
578 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  35.83 
 
 
588 aa  316  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  36.75 
 
 
582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 
577 aa  314  2.9999999999999996e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  35.88 
 
 
582 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  35.88 
 
 
582 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  37.09 
 
 
582 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  34.23 
 
 
782 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  34.58 
 
 
668 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  34.51 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  34.74 
 
 
764 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  33.21 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  35.29 
 
 
589 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  33.76 
 
 
573 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  35.64 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  34.25 
 
 
671 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  37.02 
 
 
614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.23 
 
 
593 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  35.71 
 
 
576 aa  303  8.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.26 
 
 
583 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  33.59 
 
 
563 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  34.19 
 
 
535 aa  300  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  34.25 
 
 
603 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  33.21 
 
 
583 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  32.24 
 
 
598 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  32.91 
 
 
592 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  35.27 
 
 
600 aa  293  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  33.21 
 
 
560 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  31.51 
 
 
580 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  32.51 
 
 
568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  35.36 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.74 
 
 
667 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.77 
 
 
587 aa  283  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  32.79 
 
 
588 aa  280  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  34.08 
 
 
591 aa  280  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>