More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1510 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  100 
 
 
643 aa  1282    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  49.13 
 
 
588 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.26 
 
 
585 aa  532  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  51.06 
 
 
588 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  47.1 
 
 
580 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  48.77 
 
 
587 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  48.08 
 
 
587 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.97 
 
 
591 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  48.43 
 
 
587 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  46.19 
 
 
570 aa  498  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.93 
 
 
584 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  49.64 
 
 
587 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  46.14 
 
 
578 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  45.96 
 
 
578 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  46.04 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  44.64 
 
 
603 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  46.3 
 
 
588 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  46.62 
 
 
579 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  46.32 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.7 
 
 
596 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  46.7 
 
 
572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  47.99 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  46.33 
 
 
598 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  46.04 
 
 
599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  45.84 
 
 
582 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  46.76 
 
 
593 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  46.49 
 
 
581 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.19 
 
 
585 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  44.63 
 
 
573 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  41.59 
 
 
583 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  48.4 
 
 
614 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  45.42 
 
 
577 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  44.51 
 
 
583 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  44.26 
 
 
574 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  42.42 
 
 
561 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  43.04 
 
 
582 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  42.13 
 
 
602 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  40.47 
 
 
570 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  47.03 
 
 
582 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  47.03 
 
 
582 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  42.31 
 
 
602 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  43.85 
 
 
619 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  45.13 
 
 
575 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  41.96 
 
 
602 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  44.71 
 
 
598 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.74 
 
 
593 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  42.96 
 
 
588 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  43.05 
 
 
600 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  44.58 
 
 
575 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  44.2 
 
 
578 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  44.38 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  43.03 
 
 
589 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  44.26 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  43.41 
 
 
579 aa  419  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  44.75 
 
 
582 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.23 
 
 
573 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.59 
 
 
667 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  41.89 
 
 
663 aa  412  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  39.69 
 
 
591 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  44.22 
 
 
581 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  40.18 
 
 
573 aa  412  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  40.81 
 
 
589 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  41.86 
 
 
598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.08 
 
 
587 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  40.73 
 
 
582 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  42.98 
 
 
603 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.13 
 
 
587 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  42.07 
 
 
668 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.07 
 
 
671 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  38.25 
 
 
566 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  39.46 
 
 
577 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  40.11 
 
 
742 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.88 
 
 
560 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.41 
 
 
574 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  38.78 
 
 
573 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.95 
 
 
582 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  37.74 
 
 
590 aa  392  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.86 
 
 
583 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  41.83 
 
 
592 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  40.67 
 
 
571 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.2 
 
 
592 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  47.67 
 
 
595 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  39.57 
 
 
589 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  37.3 
 
 
581 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  47.37 
 
 
596 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  41.55 
 
 
591 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  38.5 
 
 
576 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  42.81 
 
 
580 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  38.14 
 
 
782 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  40.75 
 
 
576 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  41.97 
 
 
574 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.94 
 
 
572 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  40.69 
 
 
580 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  41.39 
 
 
588 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  45.6 
 
 
575 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  38.61 
 
 
764 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  39.89 
 
 
569 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  41.03 
 
 
588 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  40.63 
 
 
573 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0244  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.88 
 
 
592 aa  362  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>