More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2948 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  54.95 
 
 		 663 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  56.17 
 
 		 764 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  57.83 
 
 		 782 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  85.84 
 
 		 668 aa  1109    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  100 
 
 		 671 aa  1344    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  60.07 
 
 		 742 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  44.66 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.57 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  40.71 
 
 		 580 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  41.42 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  41.65 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  41.29 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  41.59 
 
 		 579 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.18 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  39.71 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  42 
 
 		 643 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  37.83 
 
 		 590 aa  393  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  39.72 
 
 		 591 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  40.67 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.39 
 
 		 584 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.35 
 
 		 591 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.82 
 
 		 596 aa  388  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  40 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.52 
 
 		 592 aa  385  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.25 
 
 		 595 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  41.67 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  38.87 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  39.4 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  39.81 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  40.04 
 
 		 602 aa  382  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  40.04 
 
 		 602 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  40.04 
 
 		 602 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  40.77 
 
 		 603 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  42.17 
 
 		 619 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.64 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  38.68 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  38.69 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  38.12 
 
 		 591 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  37.7 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  39.05 
 
 		 578 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  37.89 
 
 		 576 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.95 
 
 		 587 aa  363  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  38.57 
 
 		 578 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  37.61 
 
 		 574 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  37.26 
 
 		 587 aa  360  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  38.14 
 
 		 582 aa  359  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  36.19 
 
 		 573 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.15 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  40.26 
 
 		 593 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  36.65 
 
 		 577 aa  353  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  41.64 
 
 		 575 aa  353  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  37.7 
 
 		 583 aa  353  8e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.38 
 
 		 560 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  38.67 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  37.7 
 
 		 587 aa  351  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  38.56 
 
 		 614 aa  349  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  39.56 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  38.73 
 
 		 603 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.84 
 
 		 667 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  39.65 
 
 		 572 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.29 
 
 		 573 aa  347  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  38.77 
 
 		 582 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  38.77 
 
 		 582 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  35.23 
 
 		 566 aa  343  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  41.28 
 
 		 575 aa  343  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  38.37 
 
 		 588 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  35.17 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 		 600 aa  340  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.75 
 
 		 574 aa  340  5.9999999999999996e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  37.23 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  37.05 
 
 		 573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  37.57 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  38.64 
 
 		 573 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  35.36 
 
 		 535 aa  333  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  36.84 
 
 		 580 aa  332  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.17 
 
 		 582 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  37.76 
 
 		 598 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  36.97 
 
 		 598 aa  330  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  37.92 
 
 		 569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  36.75 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  36.04 
 
 		 583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  40.97 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  41.81 
 
 		 575 aa  324  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  36.43 
 
 		 592 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  34.81 
 
 		 583 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  34.75 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  40.61 
 
 		 596 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  36.98 
 
 		 561 aa  320  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  35.54 
 
 		 589 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0276  type I secretion system ATPase  38.3 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  36.57 
 
 		 582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2781  type I secretion system ATPase  37.06 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1119  ABC protein exporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.06 
 
 		 573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  38 
 
 		 587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  36.15 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  34.15 
 
 		 589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  35.59 
 
 		 571 aa  311  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  37.55 
 
 		 581 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  34.25 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0237782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>