More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2428 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2428  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 685 aa  1409    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4147  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.92 
 
 		 694 aa  778    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0512  ABC transporter-related protein  56.89 
 
 		 699 aa  789    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  27.1 
 
 		 713 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  26.74 
 
 		 740 aa  204  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  29.19 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  25.53 
 
 		 737 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.77 
 
 		 731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  24.73 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  27.14 
 
 		 718 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  25.61 
 
 		 723 aa  184  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2136  type I protein secretion ATP-binding protein  25.05 
 
 		 704 aa  183  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  25.12 
 
 		 721 aa  180  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.71 
 
 		 725 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  26.82 
 
 		 779 aa  177  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  26.43 
 
 		 733 aa  177  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  25.87 
 
 		 712 aa  176  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  25.72 
 
 		 573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  26.57 
 
 		 712 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  28.11 
 
 		 718 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  25.91 
 
 		 726 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  25.67 
 
 		 776 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  27.89 
 
 		 722 aa  173  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.36 
 
 		 694 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.88 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  26.97 
 
 		 725 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  24.8 
 
 		 704 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  25.04 
 
 		 581 aa  171  5e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  25.18 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  26.19 
 
 		 721 aa  171  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  25.62 
 
 		 726 aa  170  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  26.97 
 
 		 723 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 720 aa  169  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  26.74 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  27.16 
 
 		 867 aa  167  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  26.61 
 
 		 725 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  26.61 
 
 		 725 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  26.3 
 
 		 725 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  26.61 
 
 		 725 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  24.82 
 
 		 704 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  24.96 
 
 		 725 aa  166  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  25.54 
 
 		 727 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  23.5 
 
 		 718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  24.77 
 
 		 740 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  26.34 
 
 		 726 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  23.66 
 
 		 718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  25.23 
 
 		 727 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  26.49 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  26.16 
 
 		 725 aa  164  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  24.56 
 
 		 776 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  26.56 
 
 		 731 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  26.74 
 
 		 733 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  26.25 
 
 		 725 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  27.5 
 
 		 756 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  27.37 
 
 		 722 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.76 
 
 		 713 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  27.37 
 
 		 722 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  26.07 
 
 		 725 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  25.09 
 
 		 583 aa  162  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  26.01 
 
 		 739 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  25.34 
 
 		 724 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.64 
 
 		 1008 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.13 
 
 		 736 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  22.77 
 
 		 750 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.64 
 
 		 1008 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  25.17 
 
 		 724 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  24.3 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  25.44 
 
 		 743 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  22.7 
 
 		 731 aa  160  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  23.92 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  26.02 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  25.78 
 
 		 587 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  24.23 
 
 		 726 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  27.37 
 
 		 722 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  27.57 
 
 		 730 aa  158  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  25.72 
 
 		 587 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  26.68 
 
 		 711 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  25.51 
 
 		 716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  26.7 
 
 		 742 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  26.81 
 
 		 718 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  26.81 
 
 		 718 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  25.23 
 
 		 577 aa  157  6e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  26.38 
 
 		 712 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  26.81 
 
 		 718 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.85 
 
 		 574 aa  157  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  26.75 
 
 		 718 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  26.51 
 
 		 667 aa  157  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  24.23 
 
 		 726 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  23.59 
 
 		 714 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  24.47 
 
 		 719 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  23.84 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  24.09 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  24.6 
 
 		 707 aa  156  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  24.71 
 
 		 886 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  23.91 
 
 		 734 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  26.16 
 
 		 721 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.04 
 
 		 1024 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  25.87 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  25 
 
 		 582 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  23.59 
 
 		 714 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>