More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4512 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4512  ABC transporter related  100 
 
 		 745 aa  1477    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  25.45 
 
 		 713 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.24 
 
 		 1003 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2136  type I protein secretion ATP-binding protein  25.12 
 
 		 704 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.75 
 
 		 1001 aa  190  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  26.27 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  24.38 
 
 		 980 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  27.92 
 
 		 723 aa  184  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  27.62 
 
 		 722 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  24.14 
 
 		 734 aa  180  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  26.93 
 
 		 740 aa  177  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.36 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  29.3 
 
 		 721 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  25.61 
 
 		 705 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  25.52 
 
 		 731 aa  174  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  25 
 
 		 718 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.31 
 
 		 971 aa  171  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  24.49 
 
 		 725 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  25.09 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  24.77 
 
 		 743 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  25.36 
 
 		 712 aa  167  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  24.77 
 
 		 724 aa  167  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  24.77 
 
 		 724 aa  167  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  25.94 
 
 		 718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  28.6 
 
 		 741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 727 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  26.7 
 
 		 886 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  25.95 
 
 		 730 aa  164  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  27.42 
 
 		 721 aa  164  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  27.55 
 
 		 739 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.44 
 
 		 1008 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.44 
 
 		 1008 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  28.63 
 
 		 733 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.29 
 
 		 731 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  27.81 
 
 		 726 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  25.45 
 
 		 714 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  27.48 
 
 		 726 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  27.48 
 
 		 726 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  27.48 
 
 		 726 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.01 
 
 		 976 aa  160  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.13 
 
 		 1024 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  27.4 
 
 		 724 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  23.61 
 
 		 740 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  27.76 
 
 		 721 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  22.1 
 
 		 930 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  25.31 
 
 		 737 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  25.9 
 
 		 740 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  27.76 
 
 		 731 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  24.87 
 
 		 1040 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  27.76 
 
 		 733 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  28.63 
 
 		 719 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  25.67 
 
 		 743 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  23.77 
 
 		 726 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  27.06 
 
 		 718 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  27.4 
 
 		 724 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  25.72 
 
 		 776 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  24.71 
 
 		 892 aa  157  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  27.34 
 
 		 871 aa  157  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.64 
 
 		 694 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  25.45 
 
 		 714 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  23.58 
 
 		 725 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  24.2 
 
 		 725 aa  156  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  27.43 
 
 		 711 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  23.77 
 
 		 725 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  28.67 
 
 		 722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4147  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 		 694 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.9 
 
 		 865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.28 
 
 		 739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  24.82 
 
 		 738 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  26.9 
 
 		 716 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  25.14 
 
 		 726 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  25.88 
 
 		 776 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  23.4 
 
 		 725 aa  154  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  24.6 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.17 
 
 		 1013 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.06 
 
 		 1012 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 		 906 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  25.65 
 
 		 906 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25 
 
 		 736 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  22.81 
 
 		 975 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  25.58 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  22.92 
 
 		 704 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.23 
 
 		 908 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  26.69 
 
 		 718 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  23.58 
 
 		 725 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  23.58 
 
 		 725 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 734 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  23.58 
 
 		 725 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  22.77 
 
 		 707 aa  152  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  23.58 
 
 		 725 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  24.09 
 
 		 704 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  25.95 
 
 		 721 aa  151  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.69 
 
 		 715 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.39 
 
 		 717 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  24.58 
 
 		 908 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  24.9 
 
 		 718 aa  151  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.31 
 
 		 725 aa  151  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  24.63 
 
 		 726 aa  151  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  25.16 
 
 		 718 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>