More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5912 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5487  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6896  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 316 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  43.64 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  28.44 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.83 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  33.81 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30.67 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  31.62 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 133 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  29.1 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 304 aa  72  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  35.66 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.85 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  34.74 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 112 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  30.7 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  25.91 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  33.58 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  30.7 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  33.58 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>