74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0657 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  100 
 
 		 172 aa  327  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  59.09 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  50.31 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  48.19 
 
 		 204 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  49.38 
 
 		 179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  49.38 
 
 		 179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  45.83 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  46.39 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  46.39 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  45.18 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  48.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  47.16 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  43.05 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  39.13 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  39.88 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  39.35 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  40.13 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  39.51 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  40.88 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  35.33 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  36.65 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  34.72 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  34.66 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  35.15 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  30.67 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  30.92 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  34.34 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  34.34 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  36.13 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  37.32 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  39.8 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  39.8 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  39.8 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  39.8 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  39.8 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  39.8 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  38.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  38.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  31.1 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  32.91 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  41.57 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  39.39 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  36.91 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  34.96 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  31.47 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  32.65 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  38 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  32.65 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  31.58 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  32.65 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  41.35 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  26.35 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  40.74 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  27.33 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  31.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  35.71 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  46.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  30.94 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.81 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2305  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  48 
 
 		 262 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  33.6 
 
 		 280 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  32.37 
 
 		 159 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  31.13 
 
 		 170 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  32.94 
 
 		 159 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  33.33 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.46 
 
 		 259 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.2 
 
 		 299 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.58 
 
 		 280 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.92 
 
 		 289 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  36.43 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  30.3 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  30.65 
 
 		 283 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>