59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2265 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  100 
 
 
179 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  91.62 
 
 
204 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  91.62 
 
 
179 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  91.62 
 
 
179 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  62.5 
 
 
179 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  62.5 
 
 
179 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  63.04 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  62.79 
 
 
179 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  61.67 
 
 
180 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  61.63 
 
 
180 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  50 
 
 
181 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  43.93 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  47.27 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  48.1 
 
 
192 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  43.93 
 
 
178 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  47.7 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  45.96 
 
 
179 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  45.18 
 
 
192 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  50.31 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  39.38 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.05 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  31.33 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  38.05 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  29.48 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  40.13 
 
 
151 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  30.81 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.63 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  31.68 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  42.47 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  37.74 
 
 
167 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  41.1 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  41.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  41.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  40.74 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  41.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  41.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  41.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  41.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  43.48 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  39.47 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  41.25 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  41.25 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  41.25 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  43.84 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  28.12 
 
 
188 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35.33 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  34.21 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  33.14 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  37.43 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  37.87 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  41.3 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  35.29 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  42.39 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  30.77 
 
 
174 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30 
 
 
299 aa  40.8  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>