40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1036 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 159 aa  289  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  38.1 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  31.37 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  36.55 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  38.69 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  34.48 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  46.09 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  39.24 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  38.56 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  30.63 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  34.15 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35.71 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  37.18 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  48.51 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  48.51 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  33.53 
 
 		 192 aa  51.2  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  28.24 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  33.14 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  39.22 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  36.54 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  34.82 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  28.28 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  37.5 
 
 		 255 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  36.42 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  28.66 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  36.42 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  35.19 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  34.78 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  35.23 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  38.89 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  38.89 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  38.89 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  33.04 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  32.68 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  32.93 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  29.9 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  29.7 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.11 
 
 		 299 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>