36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1645 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
164 aa  323  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  32.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  32.62 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  32.62 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  39.18 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  32.47 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  28.37 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  37.67 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  31.25 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  35.9 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  27.48 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2329  peptidase A24A prepilin type IV  33.55 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  29.75 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  33.77 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  28.95 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  31.37 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2708  hypothetical protein  31.21 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.133266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  33 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  32.09 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  28.95 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  29.41 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  31.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  40.43 
 
 
218 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  29.63 
 
 
188 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  28.8 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>