38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2708 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2329  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 152 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  279  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.133266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  31.21 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  35.44 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  34.34 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  34.34 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  34.34 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  35.96 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  35.96 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  33.94 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  33.94 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  33.94 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  33.94 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  33.94 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  34.92 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  33.94 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  33.94 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  31.4 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  41.88 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  30.16 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  33.72 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  34.74 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  34.44 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  33.64 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  43.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  42.16 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  42.16 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  42.16 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  43.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  43.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 		 188 aa  42  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  40.82 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  30.91 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  42.86 
 
 		 180 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  43.88 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  43.18 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  25.34 
 
 		 167 aa  40  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>