72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5993 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 179 aa  342  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  97.21 
 
 		 180 aa  313  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  81.36 
 
 		 179 aa  257  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  80.79 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  80.79 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  80.9 
 
 		 180 aa  253  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  64.04 
 
 		 204 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  64.04 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  64.04 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  62.79 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  49.7 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  47.46 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  42.78 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  46.91 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  43.75 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  41.95 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  44.44 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  43.93 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  37.42 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  47.83 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  32.93 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  35.12 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32.75 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32.75 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  29.55 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  39.05 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  34.35 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  35.54 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  40.23 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  40.23 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  40.23 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  36.21 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  39.6 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  36.89 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  42.16 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  32.3 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  39.56 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  41.1 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  39.08 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.3 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  31.14 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  39.36 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  40 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  32.95 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  30.53 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  34.95 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  32.69 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  27.16 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 457 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  30.23 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  30.57 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  33.97 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  31.33 
 
 		 159 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  31.58 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  44.9 
 
 		 288 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 		 281 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  47.06 
 
 		 296 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  28.83 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  32.32 
 
 		 250 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>