40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2040 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 185 aa  357  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  65.32 
 
 		 183 aa  204  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  66.47 
 
 		 183 aa  204  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  45.88 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  36.77 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  31.61 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  31.98 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  34.3 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  33.99 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  30.59 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  32.93 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  30.46 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  32.73 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  31.36 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  29.38 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  30.12 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  34.25 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  33.01 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  34.19 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  34.19 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  33.94 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  34.19 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  32.32 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  31.48 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  31.55 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  31.17 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  29.52 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  28.9 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  32.29 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  29.76 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  34.62 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  26.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  30.86 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  29.93 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  28.9 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  34.02 
 
 		 170 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  36.44 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>