45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4186 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 170 aa  323  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  87.06 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  59.01 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  54.66 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  41.71 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  45.4 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  40.72 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  44.51 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  41.98 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  40.61 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  38.04 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  43.59 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  40.13 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  38.18 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  37.27 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  42.86 
 
 		 168 aa  84  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  36.5 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  37.91 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  37.14 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  38.57 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  44.09 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  37.31 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  40.78 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  34.97 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  33.96 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  31.11 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  30 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  32.18 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  30 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  34.81 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  34.39 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  32.12 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  30.56 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  29.86 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  29.61 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  34.52 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  34.78 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  34.59 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0989  peptidase A24A, prepilin type IV  33.65 
 
 		 167 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  28.86 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  27.66 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>