45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2478 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 169 aa  327  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  79.88 
 
 		 172 aa  254  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  64.6 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  56.33 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  60.39 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  58.23 
 
 		 168 aa  160  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  53.29 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  51.28 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  51.97 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  51.32 
 
 		 174 aa  140  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  48.75 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  52.23 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  48.28 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  51.25 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  44.52 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  45.07 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  39.87 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  39.87 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  38.24 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  39.73 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  40.15 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  37.42 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.91 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  34.84 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  36.55 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  31.33 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  29.81 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  29.19 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  35.04 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  33.58 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  34.93 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  27.27 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  30.2 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  30.39 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  38.75 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  29.63 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  30.2 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.84 
 
 		 291 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06198  prepilin peptidase CpaA  31.13 
 
 		 112 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2354  hypothetical protein  27.34 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.306931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  28.93 
 
 		 157 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3971  peptidase A24A prepilin type IV  36.05 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0388817  normal  0.704263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2830  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2918  peptidase A24A prepilin type IV  48.57 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>