46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2406 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 172 aa  330  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  79.88 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  67.88 
 
 		 165 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  65.36 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  59.62 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  58.9 
 
 		 168 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  52.26 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  52.32 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  54.72 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  54.67 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  54.3 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  54.67 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  53.76 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  51.92 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  46.41 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  43.42 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  44.59 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  39.71 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  42.14 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  40.54 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  38.56 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  42.38 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  39.35 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.25 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  34.9 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  37.25 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  31.33 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  29.19 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  34.72 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  39.04 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  34.23 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  32.54 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  32.67 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  28.37 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  29.28 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  33.58 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  28.49 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  31.82 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1081  peptidase A24A, prepilin type IV  32.61 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2918  peptidase A24A prepilin type IV  39.6 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  33.09 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2830  peptidase A24A, prepilin type IV  43.48 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  39.02 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  32.48 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  32.28 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>