32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3033 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 167 aa  313  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  35.15 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  39.16 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  35.57 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  33.13 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  36.28 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  39.19 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  33.56 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  37.29 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  31.25 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  36.24 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  32.45 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  34.04 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  34.04 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  32.68 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  40.18 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  29.61 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  25.17 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  34.04 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  30.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  30.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  33.77 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  34.96 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  30.11 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  32.67 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  30.91 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  36.69 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  30.91 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  37.04 
 
 		 170 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  30.11 
 
 		 183 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3971  peptidase A24A prepilin type IV  41.35 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0388817  normal  0.704263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>