44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0721 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  45.09 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  42 
 
 
174 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  44.51 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  41.57 
 
 
168 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  39.63 
 
 
170 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  45.32 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  43.33 
 
 
174 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  45.77 
 
 
172 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  43.66 
 
 
169 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  43.05 
 
 
174 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  44 
 
 
174 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  45.73 
 
 
170 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  44 
 
 
174 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  45.18 
 
 
173 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  46.04 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  36.42 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  40.4 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  44.93 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  38.71 
 
 
168 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  40.58 
 
 
165 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  38.69 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  40.67 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  38.06 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  38.03 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  37.75 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  32.08 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  32.61 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  27.57 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  28.21 
 
 
159 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  41.41 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  28.21 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  27.93 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  29.19 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  36.28 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0989  peptidase A24A, prepilin type IV  30.6 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532499  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1081  peptidase A24A, prepilin type IV  31.61 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  31.29 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  30.77 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  32.9 
 
 
204 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  37.23 
 
 
218 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0326  peptidase A24A, prepilin type IV  28.92 
 
 
260 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>