264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0326 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0326  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 260 aa  484  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  41.28 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.73 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  35.32 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.76 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1113  peptidase A24A, prepilin type IV  46.88 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.93 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.6 
 
 		 291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  36.4 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.98 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  33.96 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  34.78 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  36.03 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  38.76 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.35 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.54 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  29.96 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  35.39 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  41.21 
 
 		 303 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  34.85 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  34.21 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  32.17 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  39.9 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  36.88 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2305  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.67 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  35.02 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  34.63 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  38.73 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1527  peptidase A24A domain protein  38.22 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  32.92 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  38.83 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.846368 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  39.91 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  39.91 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  33.83 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.41 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.7 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.91 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.9 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.48 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  34.78 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.61 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  35.74 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  34.7 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  33.48 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  33.74 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  34.48 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  36.19 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  33.33 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  29.2 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  34.85 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  36.4 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.96 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.46 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  33.96 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  32.73 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  33.92 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  33.74 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  32.93 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  28.75 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.84 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  28.83 
 
 		 286 aa  95.5  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.52 
 
 		 293 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  35.71 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  32.52 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  35.69 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.32 
 
 		 287 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  36.25 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  34.39 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.32 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  34.9 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  30.18 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  36.12 
 
 		 320 aa  92  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  27 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  38.35 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  34.16 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  33.07 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.69 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.08 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.86 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  35.98 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.57 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  31.46 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  36.06 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  37.5 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  37.9 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  32.23 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  34.85 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  35.57 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  37.56 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  31.19 
 
 		 308 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  34.35 
 
 		 306 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.64 
 
 		 308 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.56 
 
 		 308 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  36.19 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.15 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.18 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>