250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1591 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  100 
 
 
329 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  35.62 
 
 
274 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.62 
 
 
259 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  35.58 
 
 
274 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.25 
 
 
259 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  33.23 
 
 
259 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  34.84 
 
 
263 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.2 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  34.27 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  30.48 
 
 
264 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  35.05 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.46 
 
 
291 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  33.22 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  31.29 
 
 
258 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  37.3 
 
 
293 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  39.36 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.65 
 
 
289 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.16 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28.61 
 
 
308 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  33.33 
 
 
289 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  31.38 
 
 
283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.06 
 
 
304 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  28.33 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.75 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  32.06 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  33.45 
 
 
283 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  32.41 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.06 
 
 
304 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.93 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  33.94 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  33.11 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  27.78 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  31.29 
 
 
270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  31.29 
 
 
270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  29.86 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  37.75 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.21 
 
 
288 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.76 
 
 
293 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  35.98 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.09 
 
 
288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.55 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.89 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  32.61 
 
 
287 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  32.54 
 
 
270 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  27.9 
 
 
303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  34.18 
 
 
280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.73 
 
 
288 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  28.61 
 
 
308 aa  126  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  32.03 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.71 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  30.83 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  28.78 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.83 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.91 
 
 
293 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  32.66 
 
 
278 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.21 
 
 
280 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  32.66 
 
 
247 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  32.77 
 
 
247 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  32.64 
 
 
294 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  31.38 
 
 
288 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  28.41 
 
 
303 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.58 
 
 
281 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.82 
 
 
283 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  33.33 
 
 
246 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.61 
 
 
309 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  33.59 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.25 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  32.37 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  27.98 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  32.96 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  33.33 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  31.48 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.33 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1841  peptidase A24A domain protein  30.99 
 
 
434 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.4248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  32.65 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  31.9 
 
 
282 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.06 
 
 
308 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  34.66 
 
 
295 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  31.94 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  33.85 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.85 
 
 
265 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  33.21 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.25 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.01 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.44 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  29.44 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  34.48 
 
 
299 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  34.02 
 
 
273 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.86 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  34.6 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.86 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  34.77 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.2 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.7 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  31.88 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.77 
 
 
304 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  34.77 
 
 
304 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  34.77 
 
 
304 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>