274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2002 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  100 
 
 		 291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  75.69 
 
 		 289 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  72.92 
 
 		 289 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  64.75 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  54.71 
 
 		 283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  56.23 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  51.86 
 
 		 308 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  51.53 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  55.32 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  49.33 
 
 		 303 aa  285  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  49 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  52.4 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  50.68 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  50.68 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  54.15 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  53.79 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  52.35 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  54.06 
 
 		 290 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  52.36 
 
 		 308 aa  275  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  51.19 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  52.16 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  52.2 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  52.65 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  55.28 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  50.88 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  55.13 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  51.99 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  50.17 
 
 		 308 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  51.19 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  55.48 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  56.57 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  52.5 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  53.63 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  49.47 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  49.11 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  55.71 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  55.02 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  50.68 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  50 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  51.43 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  54.93 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  51.09 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  53.96 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  50.73 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  51.43 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  54.31 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  50.18 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  51.15 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  50.17 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  50.85 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  50.91 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  51.65 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  54.65 
 
 		 289 aa  241  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  48.35 
 
 		 280 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  54.61 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  53.51 
 
 		 293 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  47.31 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  52.01 
 
 		 289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  50.74 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  44.76 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  48.68 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  48.86 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  49.07 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  53.68 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  47.39 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  50.74 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  49.28 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  48.5 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  46.64 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  47.71 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  54.65 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  48.88 
 
 		 282 aa  224  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  48.93 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  48.34 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  47.35 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  48.41 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  52.45 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  47.72 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  49.24 
 
 		 303 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  49.24 
 
 		 303 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  45.45 
 
 		 287 aa  214  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  48.86 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  48.09 
 
 		 304 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  50.2 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  48.3 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  48.3 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  48.09 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  48.3 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  47.15 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  48.3 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  48.3 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  45.69 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  45.69 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  45.69 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  45.69 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  41.94 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  45.32 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  44.94 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  43.26 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.33 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>