266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2409 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  100 
 
 
257 aa  495  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  57.72 
 
 
260 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  53.75 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  48.45 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  47.01 
 
 
261 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  44.96 
 
 
259 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  43.8 
 
 
259 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  41.91 
 
 
263 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.22 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  40.56 
 
 
263 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  38.46 
 
 
274 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  38.46 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  41.3 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  41.9 
 
 
258 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  39.57 
 
 
291 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  42.56 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.56 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  37.05 
 
 
289 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  38.43 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  38.6 
 
 
288 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  36.33 
 
 
264 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  36.75 
 
 
302 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  42.31 
 
 
308 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  38.24 
 
 
288 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  40.43 
 
 
308 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  35.94 
 
 
295 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  38.97 
 
 
283 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  40.44 
 
 
288 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  40 
 
 
308 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  39.57 
 
 
304 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  36.59 
 
 
289 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  39.57 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.17 
 
 
308 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  39.85 
 
 
289 aa  165  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.17 
 
 
309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  40.09 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.41 
 
 
288 aa  165  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  43.58 
 
 
288 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  36.9 
 
 
297 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  34.72 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  36.46 
 
 
300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  39.22 
 
 
283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  39.15 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  37.5 
 
 
289 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.49 
 
 
299 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  38.43 
 
 
278 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  42.32 
 
 
303 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  41.42 
 
 
303 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  37.08 
 
 
318 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  38.81 
 
 
296 aa  158  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.6 
 
 
247 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  36.7 
 
 
291 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  37.4 
 
 
252 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 
304 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  40.98 
 
 
295 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  41.57 
 
 
351 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.74 
 
 
308 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  41.57 
 
 
304 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 
304 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 
304 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  41.57 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 
304 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  41.15 
 
 
294 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  39.34 
 
 
294 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  39.92 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  36.47 
 
 
309 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  41.04 
 
 
303 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  39.18 
 
 
296 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  36.74 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.21 
 
 
293 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.02 
 
 
281 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  35.22 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  40.38 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  37.19 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  40.44 
 
 
289 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.9 
 
 
287 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  38.52 
 
 
288 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  36.92 
 
 
283 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  37.74 
 
 
306 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.9 
 
 
287 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  36.82 
 
 
260 aa  151  8e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.49 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  38.2 
 
 
290 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  40.46 
 
 
293 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.82 
 
 
351 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  38.18 
 
 
293 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  37.74 
 
 
290 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  40.27 
 
 
287 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.85 
 
 
284 aa  148  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  39.63 
 
 
303 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  40.37 
 
 
320 aa  148  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.18 
 
 
293 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  36.3 
 
 
294 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.15 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  37.2 
 
 
304 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  39.48 
 
 
308 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.96 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  35.96 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  39.09 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  37.07 
 
 
305 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>