234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2305 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2305  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  100 
 
 
262 aa  484  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  41.84 
 
 
255 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  32.58 
 
 
295 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0326  peptidase A24A, prepilin type IV  38.82 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  29.37 
 
 
286 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1527  peptidase A24A domain protein  38.93 
 
 
261 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  29.79 
 
 
264 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.3 
 
 
289 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  28.62 
 
 
286 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  35.71 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.71 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  28.22 
 
 
267 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.76 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  28.46 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.97 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  31.69 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1113  peptidase A24A, prepilin type IV  50 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.97 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  27.92 
 
 
289 aa  95.5  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  29.39 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  28.85 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  32.93 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  32 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  32 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.46 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  33.61 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.23 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.61 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  30.9 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  29.52 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.68 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  26.86 
 
 
265 aa  89.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  32.19 
 
 
287 aa  89  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  32 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.92 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  35.56 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  28.27 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  29.63 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  29.64 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.42 
 
 
303 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  33.19 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  26.1 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  33.21 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.91 
 
 
288 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  30.8 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  34.38 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  31.6 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  32.89 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  29.02 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  31.38 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  33.33 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  31.78 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.93 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  34.67 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  26.25 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  32.31 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  29.41 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  27.82 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  35.94 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  25.83 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.22 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.96 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  34.06 
 
 
294 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  28.87 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  32.45 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  32.32 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  31.14 
 
 
308 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  33.33 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  31.6 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  30.51 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.19 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  25.77 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  31.6 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  31.52 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  30.83 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  30.51 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.12 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  30.41 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  32.93 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  31.11 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  30.7 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.45 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  30.09 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  30.83 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  34.02 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  37.88 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  32.77 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  31.43 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  29.61 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.14 
 
 
308 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  32.66 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.84 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.14 
 
 
309 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  32.6 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.78 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  27.56 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.14 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  30.26 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  31.58 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.846368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.85 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>