288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0982 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  100 
 
 
261 aa  510  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  73.26 
 
 
259 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  68.89 
 
 
274 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  68.89 
 
 
274 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  73.36 
 
 
263 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  70.54 
 
 
259 aa  348  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  69.8 
 
 
255 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  64.59 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  55.47 
 
 
259 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  55.69 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  48.02 
 
 
263 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  44.4 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.27 
 
 
281 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  46.46 
 
 
254 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  47.11 
 
 
250 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  47.7 
 
 
257 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  43.15 
 
 
320 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  40.07 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  41.61 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  38.23 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  42.86 
 
 
266 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.31 
 
 
247 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.86 
 
 
266 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  42.69 
 
 
252 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  37.15 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  44.84 
 
 
248 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.88 
 
 
288 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  44.31 
 
 
260 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  39.93 
 
 
289 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  45.56 
 
 
248 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  39.27 
 
 
289 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  42.86 
 
 
267 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  37.89 
 
 
295 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  37.15 
 
 
303 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  36.64 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  39.29 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  38.78 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  41.07 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  38.32 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  43.07 
 
 
288 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  37.96 
 
 
288 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  39.38 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  38.69 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  38.77 
 
 
293 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  42.44 
 
 
267 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.23 
 
 
288 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  40.59 
 
 
246 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.98 
 
 
293 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  39.58 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  36.06 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  39.07 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.94 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.41 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  33.56 
 
 
304 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  33.56 
 
 
308 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.56 
 
 
265 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  39.5 
 
 
290 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  38.71 
 
 
290 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  33.22 
 
 
308 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  44.53 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  32.87 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  41.18 
 
 
253 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.58 
 
 
329 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  37.83 
 
 
283 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  39.43 
 
 
290 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  40 
 
 
260 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  36.46 
 
 
289 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.78 
 
 
269 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  43.5 
 
 
278 aa  170  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  36.75 
 
 
318 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  37.5 
 
 
294 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  39.45 
 
 
304 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  41.27 
 
 
274 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  34.38 
 
 
308 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  39.07 
 
 
290 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  39.48 
 
 
287 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  38.06 
 
 
296 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.22 
 
 
273 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.91 
 
 
309 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  38.67 
 
 
270 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.91 
 
 
308 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  35.29 
 
 
308 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.67 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.64 
 
 
280 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  36.69 
 
 
294 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.3 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  43.11 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.26 
 
 
308 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.56 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  37.16 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  39.25 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  36.55 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  36.55 
 
 
247 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  34.66 
 
 
296 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  41.47 
 
 
250 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.64 
 
 
287 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  44.05 
 
 
321 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.26 
 
 
287 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  34.39 
 
 
303 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  35.34 
 
 
309 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>