256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1801 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 		 267 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  66.17 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  42.46 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  44.44 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  49.17 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  41.58 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  41.37 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  39.46 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  38.08 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  44.4 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.54 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  43.24 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  42.86 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  43.72 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  41.7 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  34.5 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.95 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  41.7 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  38.89 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  40.82 
 
 		 260 aa  149  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.56 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  32.32 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  35.02 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  36.8 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  35.02 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  38.15 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.43 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.16 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  33.7 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  37.91 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.41 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  35.46 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.76 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  37.04 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.04 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  38.25 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.32 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  35.34 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  35.34 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  37.96 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.32 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  35.47 
 
 		 288 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  35.47 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.02 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  34.63 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  34.84 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  37.14 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  35.14 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  34.91 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.02 
 
 		 300 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  30.34 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  36.43 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  36.49 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  35.46 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  40.4 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  31.67 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  35.4 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  36.07 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  31.97 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  34.33 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.31 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  34.18 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  33.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  32.34 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.61 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  30.51 
 
 		 290 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  35.31 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  34.48 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  36.9 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.93 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  34.77 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.09 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.61 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  35.86 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.71 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  37.79 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  32.05 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  31.89 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  37.83 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.27 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  35.82 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.01 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  33.2 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  34.94 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  31.93 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.66 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  31.33 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  30.92 
 
 		 304 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  30.92 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.2 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  36.92 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  31.6 
 
 		 286 aa  118  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.16 
 
 		 293 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  34.4 
 
 		 303 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  33.94 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  30.6 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  34.43 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  32.08 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.96 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>