242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2273 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  100 
 
 
247 aa  474  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  99.19 
 
 
247 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.13 
 
 
259 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  43.35 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.67 
 
 
281 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  42.11 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.16 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  37.75 
 
 
270 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  43.8 
 
 
254 aa  168  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.87 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  39.17 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  39.75 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35 
 
 
273 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  37.2 
 
 
259 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  35.43 
 
 
270 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  35.43 
 
 
270 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.69 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  36.18 
 
 
254 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  33.88 
 
 
250 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  34.38 
 
 
273 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  37.19 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  36.57 
 
 
274 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  35.07 
 
 
274 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  34.69 
 
 
259 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.52 
 
 
259 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  37.75 
 
 
253 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  36.63 
 
 
251 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  36.55 
 
 
246 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  39.34 
 
 
260 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  36.59 
 
 
261 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  36.44 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  38.31 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  36 
 
 
255 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  36.05 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  31.62 
 
 
263 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.21 
 
 
288 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  37.96 
 
 
267 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  34.96 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  36.89 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  29.8 
 
 
275 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  29.84 
 
 
296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  34.41 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.06 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.75 
 
 
266 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.75 
 
 
266 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  30.28 
 
 
300 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  33.33 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.31 
 
 
329 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0374  peptidase A24A-like protein  49.24 
 
 
380 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  29.89 
 
 
283 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  30.19 
 
 
288 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.58 
 
 
289 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  30.08 
 
 
288 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  31.66 
 
 
261 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.34 
 
 
265 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
239 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  31.97 
 
 
291 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.36 
 
 
299 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  32.21 
 
 
289 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  32.85 
 
 
295 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  37.07 
 
 
265 aa  122  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  31.6 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  30.74 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  31.7 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  29.21 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.56 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  32.22 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.15 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  35.74 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  33.46 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  32.77 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  32.4 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  32.34 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  32.42 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.63 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  32.34 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  30.2 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  29.22 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  46.83 
 
 
372 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  28.03 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.89 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  32.34 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  33.75 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  29.69 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  31.27 
 
 
289 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  30.07 
 
 
308 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  30.08 
 
 
283 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.85 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  31.11 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  32.05 
 
 
251 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  32.45 
 
 
287 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.44 
 
 
293 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  31.12 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  30.22 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  31.01 
 
 
299 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.08 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  33.18 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.08 
 
 
293 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.91 
 
 
287 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>