266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1340 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  100 
 
 
274 aa  530  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  56.77 
 
 
275 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  55.04 
 
 
261 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  51.84 
 
 
263 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  51.54 
 
 
262 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  41.18 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  40 
 
 
259 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.61 
 
 
259 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.02 
 
 
281 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.34 
 
 
247 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  35.74 
 
 
252 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.06 
 
 
288 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  41.09 
 
 
248 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  40.61 
 
 
270 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  37.26 
 
 
274 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  33.95 
 
 
264 aa  148  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  37.89 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  36.36 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  36.96 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  37.93 
 
 
259 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.08 
 
 
269 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.45 
 
 
273 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  40.08 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  37.19 
 
 
283 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  37.65 
 
 
250 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  34.59 
 
 
289 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  37.86 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.79 
 
 
289 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  33.22 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.51 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  33.97 
 
 
259 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  36.74 
 
 
263 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.67 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  34.93 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  35.37 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  38.46 
 
 
255 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  35.38 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  35.58 
 
 
273 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  35.8 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  37.01 
 
 
266 aa  131  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.01 
 
 
266 aa  131  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  32.54 
 
 
267 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  39 
 
 
258 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  37.25 
 
 
260 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  41.51 
 
 
283 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  35.66 
 
 
270 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  35.66 
 
 
270 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.13 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  38.67 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.8 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.41 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  34.44 
 
 
258 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  39.15 
 
 
261 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.58 
 
 
265 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  36.78 
 
 
289 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  30.98 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  37.5 
 
 
304 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  37.45 
 
 
293 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  33.33 
 
 
288 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.45 
 
 
293 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.17 
 
 
288 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  35 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  33.69 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.4 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  32.8 
 
 
303 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.33 
 
 
288 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  28.04 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  37.15 
 
 
296 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  36.9 
 
 
289 aa  118  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.05 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  34.33 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  32.28 
 
 
267 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  40.77 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.68 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  37.15 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  32.96 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0392  peptidase A24A domain protein  47.97 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  39.09 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  32.53 
 
 
290 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  34.16 
 
 
294 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  32.96 
 
 
286 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  40.34 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  36.36 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  30.69 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  36.36 
 
 
295 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.48 
 
 
329 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  32.52 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  31.03 
 
 
253 aa  112  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  39.91 
 
 
299 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  32.11 
 
 
308 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  31.71 
 
 
304 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  35.61 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  32.25 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.62 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.93 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  32.35 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>