259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2683 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  62.73 
 
 
270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  58.89 
 
 
269 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  57.35 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  57.35 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  59.04 
 
 
273 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  59.66 
 
 
239 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  51.94 
 
 
262 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  41.35 
 
 
259 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  40.31 
 
 
259 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  39.77 
 
 
252 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  43.65 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  43.65 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.92 
 
 
259 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  38.35 
 
 
259 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  39.93 
 
 
283 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  36.78 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  41.57 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  38.38 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  39.38 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  39.85 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  38.97 
 
 
274 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  38.24 
 
 
288 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  34.62 
 
 
247 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  35 
 
 
247 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  36.96 
 
 
288 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  35.29 
 
 
303 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  38.01 
 
 
294 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  38.04 
 
 
288 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  36.52 
 
 
300 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  37.23 
 
 
274 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  36.59 
 
 
288 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  35.55 
 
 
267 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.45 
 
 
247 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.29 
 
 
281 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.5 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.43 
 
 
288 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  35.79 
 
 
263 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  36.4 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  36.4 
 
 
287 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  33.96 
 
 
308 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  34.65 
 
 
303 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  35.2 
 
 
305 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  40.23 
 
 
283 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  34.77 
 
 
308 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  36.68 
 
 
261 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  34.32 
 
 
289 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  38.22 
 
 
254 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.86 
 
 
291 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  35.37 
 
 
308 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33 
 
 
289 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.18 
 
 
308 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  33.65 
 
 
308 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  33.76 
 
 
304 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  36.78 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.85 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  36.15 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.24 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  37.12 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  39.71 
 
 
296 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  37.63 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.85 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  37.02 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.45 
 
 
295 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  35.98 
 
 
281 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  36.92 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.29 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  34.56 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  37.69 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  34.85 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.53 
 
 
308 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.71 
 
 
265 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  33.44 
 
 
304 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  36.79 
 
 
291 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  40 
 
 
258 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  35.27 
 
 
287 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  34.17 
 
 
289 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.46 
 
 
293 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  38.69 
 
 
280 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.11 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.71 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  35.61 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.84 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  32.82 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  34.62 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  34.08 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.44 
 
 
284 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  36.19 
 
 
299 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  35.79 
 
 
290 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  35.79 
 
 
290 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  37.65 
 
 
267 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  38.72 
 
 
283 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  36.6 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  32.12 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  36.19 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  36.25 
 
 
260 aa  136  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.22 
 
 
299 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  34.3 
 
 
304 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  37.79 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  37.68 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>