266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0365 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  100 
 
 		 266 aa  510  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  100 
 
 		 266 aa  510  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  46.43 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  46.1 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  45.74 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  43.92 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  44.44 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  44.24 
 
 		 288 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  45.39 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  42.5 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.98 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  38.73 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  40.64 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.39 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  41.07 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  41.58 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  39.29 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  43.97 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  40.23 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.55 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  40.45 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  39.35 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  38.49 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  38.89 
 
 		 301 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  39.32 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.69 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.6 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  40.14 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  39.21 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.63 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.15 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  40.14 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  43.26 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  35.15 
 
 		 308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  39.21 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  34.81 
 
 		 308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  34.81 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  41.37 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  43.46 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  41.13 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  34.81 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  37.25 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  43.28 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.08 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  37.59 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.26 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  44.44 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.76 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  41.48 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.08 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  34.81 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.84 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  42.08 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  34.47 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  40.37 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  42.31 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  40.96 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.8 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  36.18 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.24 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  42.58 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  41.41 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  41.67 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  38.91 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  41.89 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  40.21 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.08 
 
 		 281 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  40.59 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  35.77 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  38.49 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  40.88 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  34.66 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  39.93 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  37.46 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  41.43 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  38.11 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  37.92 
 
 		 287 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  39.66 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  39.64 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  38.95 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  42.4 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  40.24 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  40.75 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  35.27 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.66 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  39.36 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.22 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  40.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  40.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  42.37 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.44 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  40.87 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  40.45 
 
 		 306 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  35.43 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  42 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  39.42 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  42.5 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.89 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  38.24 
 
 		 273 aa  159  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  42.8 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>