266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0967 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
254 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  53.06 
 
 
250 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  57.02 
 
 
248 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  50 
 
 
248 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  50.61 
 
 
250 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.63 
 
 
247 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  40.59 
 
 
252 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  43.95 
 
 
259 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  42.62 
 
 
263 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  40.24 
 
 
259 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.73 
 
 
281 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  40.83 
 
 
246 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.5 
 
 
259 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  44.13 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  39.44 
 
 
259 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  41.15 
 
 
248 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  37.13 
 
 
274 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  39.34 
 
 
254 aa  168  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  37 
 
 
274 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  40.78 
 
 
270 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  42.06 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  36.18 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  36.18 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  38.19 
 
 
263 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  42.51 
 
 
267 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  37.35 
 
 
255 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.88 
 
 
273 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  34.51 
 
 
265 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  43.2 
 
 
275 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  39.37 
 
 
270 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  39.37 
 
 
270 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  38.62 
 
 
255 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  36.65 
 
 
300 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  39.68 
 
 
253 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  35.94 
 
 
264 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.56 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  37.7 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  42.17 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  40.56 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  39.5 
 
 
260 aa  146  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  39.03 
 
 
289 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.12 
 
 
269 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  45.11 
 
 
251 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  36.43 
 
 
283 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  42.62 
 
 
257 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40.48 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  36.23 
 
 
273 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.54 
 
 
293 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  43.16 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.7 
 
 
288 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  36.06 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.89 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.45 
 
 
295 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.56 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  37.82 
 
 
239 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  39.18 
 
 
288 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  40.32 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  30.83 
 
 
267 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  35.85 
 
 
296 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.32 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.08 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  40.47 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  38.1 
 
 
288 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.83 
 
 
288 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  32.52 
 
 
308 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  32.17 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  31.47 
 
 
304 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  37.92 
 
 
288 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  36.72 
 
 
251 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.09 
 
 
289 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  35.96 
 
 
240 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  33.22 
 
 
308 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  35.42 
 
 
260 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.09 
 
 
265 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  31.82 
 
 
304 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.22 
 
 
308 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  36.43 
 
 
290 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  41.67 
 
 
262 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  32.28 
 
 
303 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  32.8 
 
 
282 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.69 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.87 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  35.53 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  28.91 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  31.69 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  39.66 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.17 
 
 
308 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  33.46 
 
 
287 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  32.1 
 
 
294 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.89 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  36.57 
 
 
288 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  33.19 
 
 
240 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.52 
 
 
309 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  33.8 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  38.27 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  29.26 
 
 
301 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.16 
 
 
284 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  34.94 
 
 
283 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.09 
 
 
289 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.6 
 
 
290 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>