257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3131 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  100 
 
 
260 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  57.51 
 
 
257 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  40.23 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  44.4 
 
 
267 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  38.02 
 
 
263 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  38.82 
 
 
263 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  47.45 
 
 
267 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  38.2 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  36.33 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  37.45 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.25 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  42.44 
 
 
266 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.44 
 
 
266 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  37.45 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  40 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  34.69 
 
 
264 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.46 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  36.62 
 
 
288 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  36.59 
 
 
288 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  38 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  37.5 
 
 
254 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  35.66 
 
 
253 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  35.71 
 
 
278 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.5 
 
 
281 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.68 
 
 
297 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  36.21 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  35.25 
 
 
303 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  32.5 
 
 
289 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  34.55 
 
 
246 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  37.36 
 
 
289 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.5 
 
 
289 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.69 
 
 
295 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  34.64 
 
 
283 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  40.2 
 
 
320 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  35.9 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  35.42 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  34.55 
 
 
318 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  36.44 
 
 
260 aa  135  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  35.14 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35 
 
 
288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  34.31 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.65 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  37.9 
 
 
255 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  35.87 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.43 
 
 
287 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.79 
 
 
287 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  34.89 
 
 
303 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  37.32 
 
 
289 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.96 
 
 
299 aa  132  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  32.57 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  36.53 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  34.07 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.54 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  33.92 
 
 
288 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  36.63 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  31.02 
 
 
301 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  35.9 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  36.33 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  32.38 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  36.16 
 
 
303 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  36.16 
 
 
303 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  35.71 
 
 
290 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.06 
 
 
303 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32.96 
 
 
309 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.26 
 
 
293 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  31.37 
 
 
265 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  32.06 
 
 
267 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  35.27 
 
 
290 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  37.28 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  32.96 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  33.86 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  32.96 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  36.16 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  30.85 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.91 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  36.44 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  34.62 
 
 
287 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  32.85 
 
 
290 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.52 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  32.96 
 
 
283 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  32.91 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  34.89 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.57 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.61 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  31.54 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  34.18 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.62 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  32.02 
 
 
303 aa  118  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.28 
 
 
304 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  34.45 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  41.47 
 
 
289 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  36.59 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  31.65 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.45 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.57 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.45 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.09 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.61 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  27.61 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>