238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2819 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  497  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  42.74 
 
 
248 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.52 
 
 
281 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  37.55 
 
 
247 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  37.14 
 
 
247 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  39.02 
 
 
248 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  36.48 
 
 
252 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  36.6 
 
 
265 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  37.14 
 
 
263 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  34.84 
 
 
259 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.74 
 
 
259 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  39.76 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.34 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  33.83 
 
 
274 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  38.02 
 
 
250 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  34.94 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  35.97 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.82 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  36.47 
 
 
254 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  35.46 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  32.11 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  34.66 
 
 
258 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.52 
 
 
259 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.02 
 
 
291 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  34.43 
 
 
254 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  34.25 
 
 
255 aa  122  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  33.47 
 
 
260 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
264 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  32.39 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  31.76 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  35.59 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  33.88 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.5 
 
 
269 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  32.03 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.07 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  35.78 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.59 
 
 
273 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  33.87 
 
 
244 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  33.87 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  32.31 
 
 
273 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  32.13 
 
 
265 aa  113  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.71 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  30.48 
 
 
283 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  33.47 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  29.84 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  29.93 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  34.18 
 
 
257 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  26.79 
 
 
271 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  29.08 
 
 
270 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  29.08 
 
 
270 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.24 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  31.3 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
278 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  31.34 
 
 
283 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.88 
 
 
287 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  30.43 
 
 
240 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  30.74 
 
 
289 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.68 
 
 
293 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0697  saccharopine dehydrogenase  33.74 
 
 
262 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  29.52 
 
 
294 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.59 
 
 
280 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  30.86 
 
 
281 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  28.14 
 
 
289 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  27.72 
 
 
289 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.05 
 
 
293 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  27.68 
 
 
303 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.65 
 
 
285 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  31.3 
 
 
239 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  30.19 
 
 
289 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  29.25 
 
 
303 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  30.19 
 
 
318 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0374  peptidase A24A-like protein  40.88 
 
 
380 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  31.11 
 
 
304 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  28.31 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  27.05 
 
 
293 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  28.35 
 
 
275 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.58 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.46 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  28.2 
 
 
294 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.46 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  29.59 
 
 
309 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  30.43 
 
 
283 aa  98.6  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.31 
 
 
329 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  28.81 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.65 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  29.89 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  27.7 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.65 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.65 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  30.65 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.65 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  30.65 
 
 
351 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  27.99 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  30.65 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0977  peptidase, A24 family  40.52 
 
 
248 aa  96.7  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.28 
 
 
299 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  27.88 
 
 
303 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  28.01 
 
 
288 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  26.57 
 
 
303 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>