259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2557 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  72.96 
 
 
251 aa  325  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  45.33 
 
 
240 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  41.48 
 
 
240 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  41.92 
 
 
240 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  41.48 
 
 
240 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  41.48 
 
 
240 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  42.54 
 
 
249 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  41.48 
 
 
240 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  41.48 
 
 
240 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  41.05 
 
 
240 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  41.92 
 
 
240 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  39.52 
 
 
259 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  41.92 
 
 
240 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.4 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.03 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  37.5 
 
 
250 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  40.76 
 
 
246 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  37.31 
 
 
274 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  37.13 
 
 
263 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  37.31 
 
 
274 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  39.92 
 
 
252 aa  154  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  36.33 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  38.96 
 
 
254 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.15 
 
 
259 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  42.74 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  40.42 
 
 
248 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.78 
 
 
259 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.98 
 
 
288 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.12 
 
 
293 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  35.56 
 
 
255 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  38.43 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  36.44 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  32.53 
 
 
259 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.48 
 
 
288 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  35.63 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  35.06 
 
 
263 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  34.23 
 
 
270 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  35.2 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  34.69 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  38.02 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  30.38 
 
 
265 aa  135  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  36.18 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.41 
 
 
269 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  33.71 
 
 
296 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  32.95 
 
 
270 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  36.36 
 
 
253 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  32.95 
 
 
270 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  34.78 
 
 
275 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.47 
 
 
300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  34.36 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.83 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  33.33 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.48 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.48 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  31.93 
 
 
301 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  35.47 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  34.1 
 
 
289 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  36.29 
 
 
266 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.29 
 
 
266 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  31.95 
 
 
288 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  36.03 
 
 
250 aa  125  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  31.58 
 
 
288 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  33.48 
 
 
308 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  32.33 
 
 
294 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  34.17 
 
 
244 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  32.98 
 
 
291 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  33.04 
 
 
308 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  33.7 
 
 
290 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  33.04 
 
 
304 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  33.72 
 
 
303 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  32.84 
 
 
290 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  32.72 
 
 
296 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.48 
 
 
290 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  31.7 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  29.33 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  33.04 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.04 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  34.82 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  31.27 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  30.68 
 
 
288 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  33.88 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  35.45 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  31.25 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  31.85 
 
 
281 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.48 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  31.41 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.48 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.15 
 
 
262 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.48 
 
 
308 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  33.33 
 
 
303 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.86 
 
 
303 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.88 
 
 
293 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  30.97 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  34.88 
 
 
293 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.54 
 
 
297 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  35.56 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  33.08 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.65 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  34.87 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>