273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3020 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  100 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  58.75 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  51.84 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  53.85 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  54.79 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.77 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  42.06 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  37.45 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  37.45 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  38.43 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.97 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  40.41 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  42.97 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  47.18 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.06 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  35.8 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.69 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  38 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.33 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  37.2 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  38.84 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  40.39 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  38.84 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  39.36 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  42.57 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.8 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  42.63 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  37.94 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  37.94 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.75 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  38.02 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  38.43 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  40.91 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.43 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  37.6 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  36.96 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  38.98 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.43 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.84 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  39.84 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  38.87 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  34.75 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.04 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.79 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  37.59 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.02 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.35 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  37.72 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  39.35 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  37.76 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  35.71 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  33.33 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  36 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  37.92 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  32.3 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.56 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.33 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  34.77 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  34.55 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  32.65 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  32.54 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  35.53 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  38.83 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  35.61 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.86 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  36.13 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  36.5 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  38.22 
 
 		 273 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  31.47 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  35.77 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.52 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  32.41 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.93 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.06 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  31.15 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  34.07 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  31.15 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  38.66 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1154  peptidase A24A-like protein  47.93 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0421152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  40.74 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  35.71 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  36.94 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  35 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  33.1 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  36.33 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  38.66 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  38.66 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.28 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.77 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  33.67 
 
 		 302 aa  131  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.8 
 
 		 265 aa  131  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  33.47 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  36.76 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  35.9 
 
 		 296 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  35.77 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.79 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  33.33 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.6 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>