260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1527 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1527  peptidase A24A domain protein  100 
 
 		 261 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  39.18 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.21 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  44.44 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  42.59 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  44.93 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.16 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  37.1 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  30.8 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.1 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  35.58 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  36.4 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  35.34 
 
 		 303 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.06 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  32.96 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  33.76 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  38.8 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.5 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  33.08 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  28.4 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  30.55 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  34.27 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  42.13 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.27 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  31.05 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.31 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  35.91 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  28.98 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  39.37 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.87 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  37.9 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.52 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  36.48 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  41.67 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  41.67 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.67 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.67 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.67 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.67 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  41.67 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  37.64 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.47 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  33.62 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  33.85 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  42.59 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  32.68 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  42.59 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  32.68 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.67 
 
 		 351 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  33.94 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  37.78 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.89 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  35.27 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  32.76 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  35.96 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  30.8 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.41 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.62 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.09 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  31.5 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  34.41 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  33.63 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  33.18 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  35.38 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  34.96 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2305  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.36 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  33.88 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  31.46 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  37.5 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  32.53 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.21 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  33.48 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  33.65 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  30.53 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  33.19 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.58 
 
 		 290 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.34 
 
 		 290 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  30.15 
 
 		 301 aa  99  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  33.09 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  32.69 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  30.34 
 
 		 305 aa  98.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  35.98 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  33.73 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  29.77 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  33.82 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  32.95 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  33.17 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.91 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  32.91 
 
 		 308 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  33.2 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  32.64 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.86 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17321  putative type 4 prepilin peptidase  37.6 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.49 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  30.6 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0326  peptidase A24A, prepilin type IV  39.91 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  35.74 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>