46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3419 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 159 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  96.86 
 
 		 159 aa  291  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  71.07 
 
 		 157 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0823  putative fimbriae assembly-related protein  47.02 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0431004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  47.02 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0338  putative fimbriae assembly-related protein  47.02 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1682  A24 family peptidase  47.02 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1871  peptidase A24A, prepilin type IV  47.02 
 
 		 172 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2038  putative fimbriae assembly-related protein  47.02 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2461  CpaA2 pilus assembly protein, putative  42.58 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  32.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  35.94 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  34.81 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  36.57 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  33.58 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  36.88 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  34.07 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  35.37 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  30.53 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  33.77 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  33.11 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  32.06 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  37.21 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  28.21 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  34.78 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  34 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  34.75 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  34.65 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  34.65 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  35.25 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  35.25 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  29.86 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  27.27 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2689  peptidase A24A prepilin type IV  38.24 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  34.93 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  33.83 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  34.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  28.39 
 
 		 166 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  34.43 
 
 		 204 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  27.85 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  28.39 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  34.07 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.78 
 
 		 248 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>