21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0338 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0823  putative fimbriae assembly-related protein  100 
 
 
159 aa  284  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0431004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0338  putative fimbriae assembly-related protein  100 
 
 
159 aa  284  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1682  A24 family peptidase  100 
 
 
159 aa  284  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
172 aa  283  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1871  peptidase A24A, prepilin type IV  99.37 
 
 
172 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2038  putative fimbriae assembly-related protein  98.74 
 
 
176 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2461  CpaA2 pilus assembly protein, putative  90.57 
 
 
161 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  47.68 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  52.35 
 
 
157 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  47.02 
 
 
159 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  30.37 
 
 
174 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  35.23 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  39.53 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  30.37 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  29.92 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  38.38 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  38.67 
 
 
170 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  40.91 
 
 
168 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  29.85 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>