23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2038 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2038  putative fimbriae assembly-related protein  100 
 
 		 176 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1871  peptidase A24A, prepilin type IV  98.84 
 
 		 172 aa  308  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  98.26 
 
 		 172 aa  307  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0823  putative fimbriae assembly-related protein  98.74 
 
 		 159 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0431004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0338  putative fimbriae assembly-related protein  98.74 
 
 		 159 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1682  A24 family peptidase  98.74 
 
 		 159 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2461  CpaA2 pilus assembly protein, putative  90.57 
 
 		 161 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  47.68 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  52.35 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  47.02 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  35.23 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  30.37 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  31.11 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  38.38 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  38.37 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32.73 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32.73 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  38.67 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  35.53 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  35 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  27.56 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  40.54 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  32.84 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>