45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0610 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 170 aa  316  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  60.4 
 
 		 170 aa  177  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  54.25 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  49.02 
 
 		 174 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  49.02 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  49.67 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  51.23 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  48.37 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  48.73 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  45.75 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  44.1 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  47.17 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  45.52 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  43.21 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  42.14 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  43.59 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  44.52 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  47.71 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  39.33 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  37.18 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  35.29 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  35.9 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  33.97 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  33.78 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  36.24 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  28.49 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  29.05 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  38.81 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  35.81 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1682  A24 family peptidase  34.56 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2038  putative fimbriae assembly-related protein  41.18 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0338  putative fimbriae assembly-related protein  34.56 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  34.56 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0823  putative fimbriae assembly-related protein  34.56 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0431004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1871  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  30.77 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  28.28 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  29.06 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  30.99 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  23.65 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  30 
 
 		 250 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  30.5 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>