51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1131 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 162 aa  314  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  52.27 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1081  peptidase A24A, prepilin type IV  41.38 
 
 		 166 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  32.08 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  34.21 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  34.87 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  41.38 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  36.81 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  32.28 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  32 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  32.59 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  31.1 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  34.04 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  32.54 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  31.91 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  34.59 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  29.33 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  33.56 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  33.12 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  37.41 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  28.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  29.17 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  36.54 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  32.41 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  31.72 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  27.64 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  29.17 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  39 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  29.46 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  32.64 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  35.92 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  34.31 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  31.76 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  35.65 
 
 		 218 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  29.52 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  32.08 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  29.09 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  27.34 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  27.34 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0687  peptidase A24A prepilin type IV  30.07 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  30.32 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  28.17 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  27.34 
 
 		 287 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  27.54 
 
 		 287 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  31.82 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  26.72 
 
 		 209 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  29.6 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.53 
 
 		 283 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0309  peptidase A24A prepilin type IV  26.5 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000294051  normal  0.397426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  28.47 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>