43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2701 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 165 aa  318  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  67.88 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  64.6 
 
 		 169 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  58 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  61.07 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  54.19 
 
 		 174 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  59.33 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  50.34 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  53.69 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  53.69 
 
 		 174 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  53.02 
 
 		 174 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  53.02 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  53.69 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  47.37 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  42.28 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  39.07 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  41.61 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  44.12 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  43.51 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  41.61 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  35.33 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  37.33 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  34.42 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  39.44 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  39.46 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  32.24 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  34.03 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  40.56 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  29.49 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  28.21 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  30.46 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  34.62 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  34.62 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1491  hypothetical protein  41.03 
 
 		 254 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2918  peptidase A24A prepilin type IV  37.91 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  27.97 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  33.09 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  25.35 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  28.67 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06198  prepilin peptidase CpaA  26.32 
 
 		 112 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  32.39 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  27.91 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  29.91 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>