39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3791 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 171 aa  330  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  49.04 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  48.41 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  47.13 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  47.77 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  49.03 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  51.23 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  43.98 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  47.77 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  46.54 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  43.12 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  44.52 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  42.38 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  43.57 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  40.67 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  41.61 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  46.1 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  43.87 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  39.22 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  39.87 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  31.21 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  34.25 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  37.18 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  32.57 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.7 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  34.25 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  32.08 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  29.37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  35.1 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  27.52 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  30.82 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  30.66 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  32.12 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  34.78 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  29.06 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  25.35 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  32.63 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>