41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5127 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 170 aa  328  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  61.96 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  46.79 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  46.79 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  46.15 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  42.58 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  44.23 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  48.08 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  43.98 
 
 		 171 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  45.62 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  44.67 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  42.94 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  40.4 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  43.38 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  41.33 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  43.92 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  37.89 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  45.86 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  38.41 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  36.25 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  35.71 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  36.49 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  34.23 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  34.25 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  35.82 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  38.57 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  31.11 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  31.11 
 
 		 132 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  28.49 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  34.26 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  35.54 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  34.65 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  34.04 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0254  type IV prepilin peptidase family protein  29.47 
 
 		 93 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000335319  hitchhiker  0.00000137879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  27.16 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  28.57 
 
 		 165 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  31.82 
 
 		 178 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  27.92 
 
 		 162 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  29.23 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>