34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0304 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  43.96 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  44.69 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  45.88 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  31.91 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  33.96 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  30 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  29.03 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  31.91 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  27.57 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  29.12 
 
 		 170 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  27.96 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  28.34 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  30.29 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  33.7 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  35.79 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  26.16 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  30.36 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  40.32 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  32.71 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  32 
 
 		 171 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  24.56 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  26.92 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  26.16 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  30.57 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  25.41 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  32.76 
 
 		 165 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  35.29 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  28.4 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  29.71 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  34.62 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  32 
 
 		 165 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>